Родился в Москве в 1984 году. С отличием окончил Московскую консерваторию (основной курс в 2010 и аспирантуру в 2013). Артист оркестра Большого Театра России (с 2010), солист Камерного оркестра «Градский Холл».

Лауреат Фестиваля камерных ансамблей «Дни Бетховена в Москве» (2003, II премия).

Иван Саенко в равной степени интересен как исполнитель старинной и современной музыки, от Средневековья и Ренессанса до наших дней. Сотрудничал с такими дирижёрами и солистами, как С. Бычков, М. Плетнёв, В. Полянский, Г. Рождественский, Э. Клас, П. Доминго, В. Ашкенази, А. Рудин, Н. Гутман, Ю. Башмет. Выступает в составе практически всех московских коллективов, исполняющих музыку на исторических инструментах. Выпустил сольный CD (2015).